Zannini está preso por la denuncia que presentó el fiscal Allberto Nisman cuatro días antes de morir. También están con prisión preventiva Cristina Kirchner -que no está presa por sus fueros como senadora- Fernando Esteche, Luis D'elia y Jorge Khalil. El juez federal Claudio Bonadio, entendió que junto con el ex canciller Héctor Timerman -en libertad por su delicado estado de salud- fue el cerebro legal del pacto con Irán y formó parte de los funcionarios que armaron una versión posterior a que se conociera la firma del acuerdo secreto.
Bonadio sorprendió al incluir a Zannini entre los acusados, ya que ni Nisman, ni siquiera el fiscal Gerardo Pollicita cuando pidió las indagatorias, lo habían incluido entre los sospechosos, publicó La Nación. Los jueces Martín Irurzun y Eduardo Farah confirmaron los procesamientos con prisión preventiva, pero cambiaron la calificación de traición a la patria, en la que el juez había encuadrado la conducta de los acusados, por la de encubrimiento.
Ahora la Cámara de Casación debe analizar si confirma o no todas las prisiones preventivas de y los procesamientos, una decisión que tomará a comienzos de marzo.