Desde el Consejo Federal resolvieron momentáneamente repartir los 36 equipos pertenecientes a la categoría en cuatro zonas de nueve conjuntos. De este modo, quedarían repartidos de la siguiente manera:
Zona A
Deportivo Madryn (Chubut).
Independiente (Neuquén).
Cipolletti (Río Negro).
Deportivo Roca (Río Negro).
Tiro Federal (Buenos Aires).
Villa Mitre (Buenos Aires).
Alvarado (Buenos Aires).
Unión de Mar del Plata (Buenos Aires). Podría anunciar su baja el 7 de enero.
General Belgrano (La Pampa).

Zona B
San Lorenzo Alem (Catamarca).
Unión Villa Krause (San Juan).
Deportivo Maipú (Mendoza).
Gutiérrez S. C. (Mendoza).
Gimnasia (Mendoza).
Ferro Carril Oeste (La Pampa).
Sportivo Belgrano (Córdoba).
Sportivo Las Parejas (Santa Fe).
Defensores de Belgrano (Buenos Aires).

Zona C
Sportivo Patria (Formosa).
Sol de América (Formosa).
Guaraní Antonio Franco (Misiones).
Chaco For Ever (Chaco).
Sarmiento (Chaco).
Gimnasia y Esgrima (Entre Ríos).
Defensores de Pronunciamiento (Entre Ríos).
Unión de Sunchales (Santa Fe).
Libertad (Santa Fe).

Zona D
Juventud Antoniana (Salta).
Gimnasia y Tiro (Salta).
San Martín (Tucumán).
San Jorge (Tucumán).
Concepción FC (Tucumán).
Unión Aconquija (Catamarca).
Altos Hornos Zapla (Jujuy).
Mitre (Santiago del Estero).
Güemes (Santiago del Estero).

En caso de confirmarse la baja de Unión de Mar del Plata (podría ocurrir el 7 de enero), las zonas podrían modificarse (serían cinco de siete equipos) o la forma de disputa, ya que la Zona A (Sur) quedaría con ocho participantes.

Según señala la información oficial, el sorteo del fixture y la confirmación de las zonas tendrá lugar recién el miércoles 13 de enero, desde las 17, en el quinto piso de la Asociación del Fútbol Argentino, recinto del Consejo Federal.

También en el borrador dado a conocer por el sitio Ascenso del Interior se incluyen las fechas de disputa estimativas. Con inicio el 7 de febrero y cierre el 7 de mayo, las jornadas de la primera fase serían las siguientes:
Febrero (5): 7, 14 (domingo), 20 (sábado), 24 y 28 (miércoles).
Marzo (6): 6 (domingo), 12 (sábado), 16 (miércoles), 20 (domingo), 26 (sábado) y 30 (miércoles).
Abril (6): 3 (domingo), 9 (sábado), 13 (miércoles), 17, 24 (domingo) y 30 (sábado).
Mayo (1): 7 (sábado).

En lo referido a la forma de disputa, se llevará a cabo por el sistema de adición de puntos en las zonas, las cuales se jugarán todos contra todos a dos ruedas, con partidos de ida y vuelta. Clasificarán a las fases restantes (según corresponda) desde el primero al cuarto de cada zona y los dos mejores ubicados en el quinto lugar. Esto daría un total de 18 equipos.

Estos 18 serán ordenados para las siguientes instancias del torneo de la siguiente forma:
-El primer puesto (1°) quedará definido para el que haya obtenido más puntos entre los que terminaron primeros.
-El segundo puesto (2°) quedará definido para el segundo que haya obtenido más puntos entre los que terminaron primeros.
-El tercer puesto (3°) quedará definido para el tercero que haya obtenido más puntos entre los que terminaron primeros.
-El cuarto puesto (4°) quedará definido para el que haya obtenido menos puntos entre los que terminaron primeros.
-El quinto puesto (5°) quedará definido para el que haya obtenido más puntos entre los que terminaron segundos.
-El sexto puesto (6°) quedará definido para el segundo que haya obtenido más puntos entre los que terminaron segundos.
-El séptimo puesto (7°) quedará definido para el tercero que haya obtenido más puntos entre los que terminaron segundos.
-El octavo puesto (8°) quedará definido para el que haya obtenido menos puntos entre los que terminaron segundos.
-El noveno puesto (9°) quedará definido para el que haya obtenido más puntos entre los que terminaron terceros.
-El décimo puesto (10°) quedará definido para el segundo que haya obtenido más puntos entre los que terminaron terceros.
-El undécimo puesto (11°) quedará definido para el tercero que haya obtenido más puntos entre los que terminaron terceros.
-El duodécimo puesto (12°) quedará definido para el que haya obtenido menos puntos entre los que terminaron terceros.
-El decimotercer puesto (13°) quedará definido para el que haya obtenido más puntos entre los que terminaron cuartos.
-El decimocuarto puesto (14°) quedará definido para el segundo que haya obtenido más puntos entre los que terminaron cuartos.
-El decimoquinto puesto (15°) quedará definido para el tercero que haya obtenido más puntos entre los que terminaron cuartos.
-El decimosexto puesto (16°) quedará definido para el que haya obtenido menos puntos entre los que terminaron cuartos.
-El decimoséptimo puesto (17°) quedará definido para el quinto con más puntos.
-El decimoctavo puesto (18°) quedará definido para el segundo quinto con más puntos.

En caso de haber igualdad en obtención de puntos entre primeros; segundos; terceros; cuartos; o quintos, el sistema de diferenciación será el siguiente:
a) Mayor diferencia de goles.
b) Mayor cantidad de goles a favor.
c) Sorteo.

De estos 18 elencos, Los clubes ubicados 1°, 2°, 3° y 4° clasifican a la Cuarta Fase, el 5° y 6° a la Tercera Fase y del 7° al 18° a la Segunda Fase. Los otros 18 clubes pasarán a disputar la Fase Descenso.

Segunda Fase
La segunda fase se disputará los miércoles 11 y 15 de mayo e incluirá seis enfrentamientos mano a mano de ida y vuelta con un partido en cada sede, en los que participarán los doce clubes ubicados entre el 7° y el 18° lugar. Los partidos se jugarán de la siguiente manera:
7° - 18°.
8° - 17°.
9° - 16°.
10° - 15°.
11° - 14°.
12° - 13°.

Los locales del primer partido serán los peor ubicados. De aquí, los seis ganadores clasificarán a la Tercera Fase.

Tercera Fase
La tercera fase se disputará el domingo 22 y el sábado 28 de mayo e incluirá cuatro partidos entre los clasificados de la Segunda Fase (irán del 3° al 8° lugar) y el 5° y 6° del ordenamiento original (serán el 1° y el 2° respectivamente). Serán cotejos de ida y vuelta, uno en cada sede, y se ordenarán de la siguiente manera:
1° - 8°.
2° - 7°.
3° - 6°.
4° - 5°.

Los locales del primer partido serán los peor ubicados. De aquí, los cuatro ganadores clasificarán a la Cuarta Fase.

Cuarta Fase
La cuarta fase se disputará el miércoles 1 y domingo 5 de junio e incluirá cuatro enfrentamientos entre los clasificados de la Tercera Fase (ocuparán del 5° al 8° lugar en esta instancia) y del 1° al 4° del ordenamiento original (se respetarán sus posiciones) en cotejos de ida y vuelta, con un partido en cada sede. El ordenamiento será el siguiente:
1° - 8°.
2° - 7°.
3° - 6°.
4° - 5°.

En el primer partido serán locales los peor ubicados. De aquí, los cuatro ganadores clasificarán a las Quinta Fase.

Quinta Fase
La quinta fase se disputará el sábado 11 y el miércoles 15 de junio, e incluirá a los cuatro ganadores de la cuarta fase. Será en series de ida y vuelta con un partido en cada sede y se respetará el ordenamiento de la Cuarta Fase. Los duelos serán los siguientes:
1° - 4°.
2° - 3°.

En el primer partido serán locales los peor ubicados. De aquí, los dos ganadores calsificarán a la Sexta Fase o Final.

Sexta Fase (Final)
La sexta fase se disputará los domingos 19 y 26 de junio y estará integrada por los dos clubes ganadores de la fase previa. Se respetará el ordenamiento y contará con duelos de ida y vuelta, uno en cada sede. Hará de local en el primer cotejo el peor ubicado, en tanto que el ganador de este partido, obtendrá el ascenso hacia el Torneo Nacional edición 2016/17.

Los dieciocho clubes que quedaron fuera de competencia por el ascenso hacia la segunda categoría del fútbol argentino, disputarán una Fase de Descenso en la cual serán divididos en dos zonas de nueve. Las fechas de disputa serán las siguientes:
Mayo (4): 14 (sábado), 18 (miércoles), 22 y 29 (domingo).
Junio (5): 4 (sábado), 8 (miércoles), 12, 19 y 26 (domingo).

En esta fase se tendrá en cuenta la cantidad de puntos que sume cada equipo al cabo de las nueve fechas (se jugará una sola rueda). En esta instancia, los dieciocho equipos comenzarán sin puntos. Una vez finalizada esta etapa, se confeccionará por zona la Tabla General de Posiciones (suma de puntos de las Primera Fase y Fase Descenso), los clubes ubicados en la 9° posición en cada una de las tablas descenderán al Torneo Federal B 2016/17.

En todos los casos de empates en puntos de dos o más clubes de la misma zona, a los fines de determinar descensos se realizarán partidos definitorios entre ellos, de acuerdo a lo establecido en el Art. 111° del Reglamento General de la AFA.

Definiciones de la Primera Fase
Ningún partido exigirá definición. Todos finalizarán invariablemente al cabo de los noventa (90) minutos de juego, con la salvedad obvia de aquellos minutos que pudiera añadir el árbitro del encuentro.

En caso de existir igualdad en puntos al término de la disputa de alguna de las Zonas, a los efectos de establecer una clasificación en esta fase se aplicará el siguiente sistema:
En favor del club que, considerando exclusivamente los partidos disputados en la Primera Fase, contra aquel o aquellos con los que hubiera empatado la posición, hubiera obtenido mayor cantidad de puntos o, en caso de empate, en el siguiente orden:
a) Mayor diferencia de goles.
b) Mayor cantidad de goles a favor.
c) Mayor cantidad de goles a favor como visitante.

Si por aplicación de algunos de los puntos precedentes se definieran posiciones en forma parcial (cuando el empate es entre tres o más clubes), se comenzará nuevamente a definir las posiciones en el orden establecido en este artículo.

En caso de no existir definición por este sistema se deberá recurrir a la tabla general de la zona, contabilizándose la totalidad de los partidos disputados, en el siguiente orden:
d) Mayor diferencia de goles.
e) Mayor cantidad de goles a favor.
f) Mayor cantidad de goles como visitante.

Este proceso se repetirá cuantas veces sea necesario.
g) Una vez agotadas las alternativas previstas en los ítems anteriores, de persistir el empate a la finalización de esta Fase, en cualesquiera de las posiciones que determinen clasificación para su prosecución en el certamen, y si luego de aplicarse los ítems anteriores, (a, b, c, d, e, f,) no existiera definición, se recurrirá a determinar la posición por medio de un sorteo, dentro de las 48 horas, a efectuarse en sede del Consejo Federal.

En caso de existir igualdad en puntos al término de la disputa de la Primera Fase y a los efectos de establecer la clasificación de los dos mejores equipos ubicados en el quinto lugar, se aplicará el siguiente sistema:
a) Mayor diferencia de goles.
b) Mayor cantidad de goles a favor.
c) Mayor cantidad de goles a favor como visitante.
d) Una vez agotadas las alternativas previstas en los ítems anteriores, de persistir el empate a la finalización de la etapa o ronda la posición se definirá por medio de un sorteo a realizarse en sede del Consejo Federal, dentro de las 48 horas.

Definiciones de Partidos Eliminatorios
1. En favor del equipo que hubiera obtenido más puntos en la serie de partidos disputado entre una pareja de equipos.
2. De existir igualdad, en favor del equipo que obtuviera mayor diferencia de gol en esa serie.
3. En caso de no existir definición por los puntos anteriores se deberá recurrir a la ejecución de tiros desde el punto del penal, conforme las previsiones del artículo 111° del Reglamento General de la AFA.